Я думаю, что объяснение было на уровне реальности, т.е. такое объяснение, какое нашли те люди, которые там убегали от монстров, а не авторское объяснение со стороны.
Мне он именно этим и понравился, реалистичностью, никаких вмешательств извне, никакой руки автора, а только действия людей.
Корабль не летал сотни лет, он уже давно прилетел и сотни лет лежал на дне моря той планеты.
Проснувшиеся люди ели еду которая имелась на корабле, а туда добавили ускорители эволюции, мутагены, чтобы они адаптировались к условиям другой планеты, а потом еда кончилась, а жрать то хотелось, стали жрать тех кто в капсулах и в итоге мутировали в монстров.
Иллюминаторов на корабле небыло, только на командном мостике, который был закрыт и только с самом конце они туда добрались и поняли что не в космосе находятся а на дне.