Дай злодеям отведать черепашьей силы! Крэнг удерживает Микеланджело в своей лаборатории, в камере, защищенной лазером. Используй остатки пиццы Микеланджело, чтобы превратить безвыходную ситуацию в ловкий побег! Просунь пиццу через прутья тюремной решётки, чтобы пехотинец поскользнулся и упал! Затем активируй взрывную функцию на клетке Микеланджело, чтобы совершить побег! Как только черепашка окажется на свободе, сразись с Крэнгом, сидящим в своём ужасающем шагающем роботе с двойными манёвренными лазерными ракетами. Приготовься к жуткой прогулке по сточным водам города, когда Крэнг отсоединит ноги шагающего робота, чтобы сделать летающую спасательную капсулу. Не дай ему ускользнуть!
В Логове Черепах день напряжённых тренировок. Обучай Леонардо искусству ниндзя с помощью учителя Сплинтера и вращающегося учебного манекена. Затем займись экспериментами в лаборатории Донни. Когда Тёмный Ниндзя и его приспешник пехотинец приведут в действие взрывное устройство, придёт время проявить черепашью силу в сражении ниндзя! Веди бой на всех 3 этажах Логова Черепах с помощью 10 орудий и печки, стреляющей пиццей. Заставь этих злодеев заплатить за проникновение на территорию черепашек! Когда сражение закончится, разожги печь для пиццы и расположись на станции для видеоигр с плоским телеэкраном. Или выберись на улицу со скейтбордом и покатайся с минипандуса.