пока рано имхо на линукс переходить какой бы он там не был.
Во первых, тебе нужна будет служба аналогичная Active Directory в линуксе. Единственный кандидат на эту роль (беплатный) это openldap но пока ты его настроишь корректно для работы в сети пройдет оччень не мало времени, я не сомневаюсь в твой компетенции, но ты сам упомянул, что линукс в глаза еще не видел. Я представляю такую схему. Сеть из машин 100-200, процентов сорок машин на винде процентов шестьдесят машин на линуксе.
И сервера
1. Бэкап сервер. (Amanda, Baacula, etc)
2. Веб сервер (Апач однозначно)
3. Proxy сервер (Squid однозначно)
4. Файл сервер (Samba imho)
5. Почта (qmail, exim, etc)
6. По мере необходимости DHCP сервер
7. Маршрутизатор, файрволл в одном лице (iptables)
8. И чтобы все это заработало в связке - нужен openldap.
Если все таки надумаешь ставить, то советую ставить АСПЛинукс, они там с 1С партнеры теперь. Как я понял в следующем релизе 1С будут полностью работать а платформе линукс.
Во вторых
Как ты будешь работать с офисом ?
Опеннофис очень хорошая и мощная вещь, но не будем кривть душой, еще достаточно глюков наблюдается, при работе с вордовскими документами. Флаг тебе в руки, если ты сможешь заставить своих пользователей пересесть на swx или rtf.
И еще многго всяких заусениц на пути встретится, но все это я говорю не для того чтобы отговорить тебя от безумной идеи, а для того чтобы ты просто понял задачу и оценил свои силы.